军事交往是安卡拉-耶路撒冷协议的核心，这项军事训练协议于1996年2月签订，允许以色列的空军喷气式飞机在安纳托利亚上空飞行，由此土耳其成为穆斯林世界中第一个与以色列建立正式军事关系的国家。
同样的，协议也会终止。因土耳其涉嫌把最先进的电光感应式军事情报系统卖给以色列的敌对国家，以色列终止了于2008年与土耳其签订的价值1.41亿美元的军事协定。
 在2009年初，埃尔多安和希蒙•佩雷斯（Shimon Peres）上演了一场高层的突破。 |
评论：2002年，不幸的是，伊斯兰的政党在土耳其奇特的政治选举中胜出并治理这个国家—但至少以色列（和法国）发现了这个变化，而不像美国，总是坚定地以为万事大吉。（2011.12.22）
2012年1月22日更新：虽然军事事务停止了，可是双方的贸易却在持续增长。令人惊奇的是，2011年以色列对土耳其的出口贸易比去年增长了42%，和对德国的出口相差无几（18.5亿对比19.4亿）。以色列在2011年从土耳其的进口贸易也比去年多21%，增至21亿美元。
